ЕC запретила девяти российским авиакомпаниям полеты над своей территорией. В пресс-релиз министерства транспорта России, выпущенном по этому поводу, в частности, отмечается: "Во избежание нанесения значительного ущерба Российской Федерации как одной из ведущих авиационных держав, а также в целях повышения безопасности полетов Ространснадзор и Росавиация совместным распоряжением запретили девяти авиакомпаниям с 12 февраля 2007 года и вплоть до урегулирования полученных замечаний выполнение чартерных и разовых полетов в страны Евросоюза".
Выполнять разовые и чартерные рейсы в страны ЕС запрещено следующим авиакомпаниям: "Аэро Рент", "Татарстан", "Атлант-Союз", "Авиакон Цитотранс", "Центр Авиа", "Газпромавиа", "Лукойл", "Русское небо" и "ЮТэйр".
В полный "черный список" авиакомпаний, которым запрещены полеты в страны ЕС из-за несоблюдения мер безопасности, входят также компании из КНДР, Афганистана, Уганды, Кении, Казахстана, Руанды, Конго, Экваториальной Гвинеи, Киргизии, Либерии, Сьерра-Леоне, Свазиленда, Бангладеша и Судана. Как отмечает Gzt.ru, впервые в истории применения запретов на полеты из перечня штрафников были исключены две авиакомпании, устранившие нарушения. Ими стали Phuket Air (Таиланд) и DAS Air Cargo/Dairo Air Services (Уганда, Кения).
Некоторым авиакомпаниям Еврокомиссия разрешила продолжать полеты, однако с определенными оговорками. Например, Pakistan International Airlines (Пакистан) может совершать полеты в ЕС только самолетами Boeing 777.