Îäíàêî ýòèì ïëàíàì íå ñóæäåíî ñáûòüñÿ.  õîäå ðàáîò ñòðîèòåëè ñòîëêíóëèñü ñ òðóäíîñòÿìè, êîòîðûå íå ñìîãëè ïðåäâèäåòü íè ñïåöèàëèñòû, íè êîìïüþòåðíûå ðàñ÷åòû. Áîëüøîé òåàòð ðàñïîëîæåí íà çûáêèõ ïî÷âàõ, ïåðåæèë íåñêîëüêî ïîæàðîâ è íå âñåãäà óäà÷íûõ ðåìîíòîâ. Ïî ñëîâàì Èêñàíîâà, äðóãîãî òàêîãî ñëîæíîãî ïðîåêòà, êàê ðåêîíñòðóêöèÿ Áîëüøîãî òåàòðà, â ìèðå åùå íå ïðåäïðèíèìàëîñü. Ñòðîèòåëè çíàëè, ÷òî áîëåå ïîëîâèíû âñåõ ïëîùàäåé ïðåáûâàåò â àâàðèéíîì ïîëîæåíèè. Íî íà ïîâåðêó îêàçàëîñü, ÷òî çäàíèå íàõîäèòñÿ â åùå áîëåå âåòõîì ñîñòîÿíèè. Èñòîðè÷åñêèé ôóíäàìåíò ïðàêòè÷åñêè ïðåâðàòèëñÿ â òðóõó.
Êîãäà ñòðîèòåëè îòñêîáëèëè øòóêàòóðêó, îáíàðóæèëîñü 15 ñèëîâûõ òðåùèí, ïðîíçèâøèõ çäàíèå îò ôóíäàìåíòà äî êðîâëè. Ñòåíû âî ìíîãèõ ìåñòàõ íàñòîëüêî èñòëåëè, ÷òî ïðîñòî ðàññûïàëèñü â ïðàõ. Ïîýòîìó èõ ïðèøëîñü îòñòðàèâàòü çàíîâî. À â öåëîì çäàíèå ïðèøëîñü ñòÿãèâàòü ñïåöèàëüíûìè "ïîÿñàìè", êàê äåðåâÿííóþ áî÷êó.  õîäå ðàáîò òàêæå áûëè îòêðûòû íîâûå èñòîðè÷åñêèå äåòàëè è ôðàãìåíòû, êîòîðûå ðåøåíî ñîõðàíèòü. Ïðåäïîëàãàåòñÿ, ÷òî âíåøíèé îáëèê Áîëüøîãî òåàòðà áóäåò ñîõðàíåí, çà èñêëþ÷åíèåì ïðèñòðîåê ñåâåðíîãî ôàñàäà. Ðàñïîëàãàâøèåñÿ òàì õðàíèëèùå äåêîðàöèé è äâà ðåïåòèöèîííûõ çàëà ïåðåìåñòÿòñÿ ïîä çåìëþ. ×òîáû ñïðàâèòüñÿ ñ íîâûìè çàäà÷àìè, íà "ñòðîéêå âåêà" ââåäåíû òðè ñìåíû, è ñòðîèòåëè òåïåðü ðàáîòàþò â êðóãëîñóòî÷íîì ðåæèìå.
Íåïðåäâèäåííûå îñëîæíåíèÿ íåèçáåæíî ïîâëåêóò óâåëè÷åíèå è áåç òîãî ãèãàíòñêîãî áþäæåòà ðåêîíñòðóêöèè. Íî îòêóäà áðàòü ñðåäñòâà, ïîêà íå èçâåñòíî. Âåäü Ìèíýêîíîìðàçâèòèÿ âûäåëèëî Áîëüøîìó 15 ìëðä. ðóáëåé ñ íåïðåìåííûì óñëîâèåì, ÷òî äàííàÿ ñóììà íå áóäåò óâåëè÷åíà íè íà êîïåéêó. Òåïåðü îêàçûâàåòñÿ, ÷òî íóæíû íå òîëüêî äîïîëíèòåëüíûå äåíüãè, íî è âðåìÿ.
Äèðåêöèÿ Áîëüøîãî âñå æå íå õî÷åò ìåíÿòü ñâîè ïëàíû ïî îòêðûòèþ ñòàðîé ñöåíû è ñåé÷àñ âåäåò ïåðåãîâîðû ñ èòàëüÿíöàìè î ïåðåíîñå ãàñòðîëåé àðòèñòîâ "Ëà Ñêàëà" íà ãîä. Íå ôàêò, ÷òî ýòî óäàñòñÿ, âåäü ó çàïàäíûõ òåàòðîâ òàêîãî óðîâíÿ ãàñòðîëüíîå ðàñïèñàíèå ðàñïèñàíî âïåðåä íà 5-7 ëåò, è êàêèå-ëèáî ïåðåíîñû ïðèíèìàþùåé ñòîðîíû ìîãóò ïðèâåñòè ê ñêàíäàëàì è âûïëàòàì áîëüøèõ íåóñòîåê.